| スカルノ・ハッタ国際空港 CGK | ジャボデタベック | 99 |
| ングラ・ライ国際空港 DPS | デンパサール | 66 |
| ジュアンダ国際空港 SUB | スラバヤ | 43 |
| ハサヌディン国際空港 UPG | マカッサル | 40 |
| クアラナム国際空港 KNO | メダン | 27 |
| セピンガン国際空港 BPN | バリクパパン | 25 |
| ハン・ナディム国際空港 BTH | バタム | 22 |
| サム・ラトゥランギ国際空港 MDC | マナド | 20 |
| ジョグジャカルタ国際空港 YIA | ジョグジャカルタ国際空港 | 20 |
| クパン KOE | クパン | 18 |
| ソロン SOQ | ソロン (インドネシア) | 16 |
| センタニ空港 DJJ | ジャヤプラ | 15 |
| アフマド・ヤニ国際空港 SRG | スマラン | 14 |
| ミナンカバウ国際空港 PDG | パダン | 14 |
| パティムラ空港 AMQ | アンボン | 14 |
| スパディオ空港 PNK | ポンティアナック | 14 |
| シャムスディン・ノール空港 BDJ | バンジャルマシン | 14 |
| コモド空港 LBJ | ラブハンバジョ | 13 |
| ロンボク国際空港 LOP | マタラム | 13 |
| スルタン・シャリフ・カシムII国際空港 PKU | プカンバル | 13 |
| ハリム・ペルダナクスマ国際空港 HLP | ジャカルタ | 12 |
| テルナーテ TTE | テルナーテ | 12 |
| スルタン・ムハンマド・バダルディン2世国際空港 PLM | パレンバン | 12 |
| ムティアラ・SIS・アル・ジュフリー空港 PLW | パル | 11 |
| ティミカ空港 TIM | ティミカ | 10 |
| レンダニ空港 MKW | マノクワリ | 10 |
| スルタン・イスカンダル・ムダ空港 BTJ | バンダ・アチェ | 10 |
| フセイン・サストラネガラ空港 BDO | バンドン | 8 |
| サマリンダ国際空港 AAP | サマリンダ | 7 |
| タラカン TRK | タラカン市 | 7 |
| トゥジリク・リウトゥ空港 PKY | パランカラヤ | 7 |
| ダボ・シンケップ空港 SIQ | ダボ・シンケップ空港 | 6 |
| デパティ・アミール空港 PGK | パンカルピナン | 6 |
| Douw Aturure Airport NBX | Nabire | 6 |
| ジャラルディン空港 GTO | ゴロンタロ | 6 |
| モパ空港 MKQ | モパ空港 | 6 |
| スルタン・タハ空港 DJB | ジャンビ | 6 |
| マタハウ空港 WGP | ワインガプ | 6 |
| Fak Fak空港 FKQ | Fak Fak空港 | 5 |
| フランス・カイシイエポ国際空港 BIK | フランス・カイシイエポ国際空港 | 5 |
| ウォルターモンギシディ空港 KDI | ケンダリ | 5 |
| Kalimarau Airport BEJ | タンジュン・レデップ | 5 |
| ワメナ空港 WMX | ワメナ空港 | 5 |
| アディスマルモ国際空港 SOC | スラカルタ | 4 |
| Arung Palakka Airport APD | Bone | 4 |
| バボ BXB | バボ | 4 |
| Binaka Airport GNS | Gunungsitoli | 4 |
| ファトマワティ・スカルノ空港 BKS | ブンクル | 4 |
| Iskandar Airport PKN | Pangkalanbun | 4 |
| Long Apung Airport LPU | Long Apung-Borneo Island | 4 |
| Maleo Airport MOH | Morowali | 4 |
| ナハ空港 NAH | ナハ空港 | 4 |
| Robert Atty Bessing LNU | Malinau | 4 |
| Sabu-Tardanu Airport SAU | Sabu-Sawu Island | 4 |
| Stenkol Airport NTI | Bintuni | 4 |
| シュクラン・アミヌッディン・アミール空港 LUW | ルウク (インドネシア) | 4 |
| Tambolaka Airport TMC | ワイカブバック | 4 |
| カイマナ空港 KNG | カイマナ空港 | 4 |
| Yuvai Semaring Airport LBW | Long Bawan | 4 |
| アジスチプト国際空港 JOG | ジョグジャカルタ市 | 3 |
| Andi Jemma Airport MXB | Masamba | 3 |
| バニュワンギ BWX | バニュワンギ | 3 |
| チュ・ニャ・ディン空港 MEQ | チュ・ニャ・ディン空港 | 3 |
| Departi Parbo Airport KRC | スンガイ・ぺヌー | 3 |
| Dr. Ferdinand Lumban Tobing Airport FLZ | シボルガ | 3 |
| Frans Xavier Seda Airport MOF | マウメレ | 3 |
| ハンジャンジョデェエン国際空港 TJQ | ハンジャンジョデェエン国際空港 | 3 |
| H. Hasan Aroeboesman (Ende) Airport ENE | エンデ (インドネシア) | 3 |
| Jos Orno Imsula Airport JIO | Tiakur | 3 |
| Lasikin Airport LKI | Lubang | 3 |
| Letung Airport LMU | Bukit Padi | 3 |
| Melalan Airport GHS | Melak-Borneo Island | 3 |
| Melangguane Airport MNA | Karakelong Island | 3 |
| オクシビル空港 OKL | オクシビル空港 | 3 |
| ラディン・インテン2世空港 TKG | ラディン・インテン2世空港 | 3 |
| ケタパン KTG | ケタパン | 3 |
| ラジャ・ハジ・フィサビッリラー空港 TNJ | タンジュン・ピナン | 3 |
| ドボ DOB | ドボ | 3 |
| サンピット SMQ | サンピット | 3 |
| ビマ空港 BMU | ビマ | 3 |
| Tanjung Harapan Airport TJS | Tanjung Selor-Borneo Island | 3 |
| マラン MLG | マラン | 2 |
| Atung Bungsu Airport PXA | Bentayan | 2 |
| Ayawasi Airport AYW | Ayawasi | 2 |
| Bajawa Soa (Turelelo) Airport BJW | Soa | 2 |
| Bersujud Airport BTW | Batu Licin | 2 |
| Bokondini Airport BUI | Bokondini | 2 |
| Bolaang Mongondow Airport LKM | Lolak | 2 |
| Bua - Palopo Lagaligo Airport LLO | Palopo | 2 |
| ブオル空港 UOL | ブオル空港 | 2 |
| David Constantijn Saudale Airport RTI | Ba'a - Rote Island | 2 |
| Dewadaru Airport KWB | Karimunjawa | 2 |
| Dhoho International Airport DHX | クディリ | 2 |
| Emalamo Airport SQN | Sanana | 2 |
| Ewer Asmat Airport EWE | Agats | 2 |
| Frans Sales Lega Airport RTG | ルトゥン | 2 |
| Haji Muhammad Sidik Airport HMS | Muara Teweh | 2 |
| カレル・サドゥイトゥブン空港 LUV | カレル・サドゥイトゥブン空港 | 2 |
| クルタジャティ国際空港 KJT | クルタジャティ国際空港 | 2 |
| Kornasoren Airport FOO | Nomfor | 2 |
| Kuabang Airport KAZ | Kao | 2 |
| Matahora Airport WNI | Wangi-wangi Island | 2 |
| Mathilda Batlayeri Airport SXK | サウムラキ | 2 |
| Miangas Airport IAX | Miangas | 2 |
| Muara Bungo Airport BUU | Muara Bungo | 2 |
| Muko Muko Airport MPC | Muko Muko | 2 |
| Nop Goliat Dekai Airport DEX | Dekai | 2 |
| Nusawiru Airport CJN | Cijulang | 2 |
| Oesman Sadik Airport LAH | ラブハ | 2 |
| Raja Haji Abdullah Airport TJB | Tanjung Balai-Karinmunbesar Island | 2 |
| Ranai Airport NTX | Ranai-Natuna Besar Island | 2 |
| Seruyan Kuala Pembuang Airport KLP | Seruyan | 2 |
| Siau/Sitaro Airport BRG | Balirangen | 2 |
| シランパリ空港 LLJ | ルブクリンガウ | 2 |
| シランギット国際空港 DTB | シランギット国際空港 | 2 |
| Stevanus Rumbewas Airport ZRI | Serui | 2 |
| Sultan Muhammad Kaharuddin III Airport SWQ | スンバワ・ベサル | 2 |
| Tampa Padang Airport MJU | Mamuju | 2 |
| Tanah Merah Airport TMH | Tanah Merah | 2 |
| Tanjung Api Airport OJU | Tojo Una-Una | 2 |
| Toraja Airport TRT | Toraja | 2 |
| AA Bere Tallo (Haliwen) Airport ABU | アタムブア | 1 |
| Alas Leuser Airport LSR | クタケーン | 1 |
| マリ空港 ARD | マリ空港 | 1 |
| Anggi Airport AGD | Anggi-Papua Island | 1 |
| ベトアンバリ空港 BUW | バウバウ | 1 |
| Buli Airport PGQ | Pekaulang | 1 |
| Datadawai Airport DTD | Datadawai-Borneo Island | 1 |
| Enarotali Airport EWI | Enarotali | 1 |
| Enggano Airport ENG | Enggano | 1 |
| Gamarmalamo Airport GLX | Galela | 1 |
| Gebe Airport GEB | Gebe Island | 1 |
| コタバル KBU | コタバル | 1 |
| ハルン・トヒル空港 BXW | ハルン・トヒル空港 | 1 |
| Japura Airport RGT | Rengat-Sumatra Island | 1 |
| Kasiguncu Airport PSJ | Poso-Celebes Island | 1 |
| Larantuka Gewayentana Airport LKA | Tiwatobi | 1 |
| Maimun Saleh Airport SBG | Sabang | 1 |
| マリクッサレー空港 LSW | ロークスマウェ | 1 |
| Marinda Airport RJM | Waisai | 1 |
| ロコット空港 RKI | ロコット空港 | 1 |
| Namniwel Airport NAM | Namniwel | 1 |
| Namrole Airport NRE | Namrole | 1 |
| Notohadinegoro Airport JBB | Jember | 1 |
| Nunukan Airport NNX | Nunukan-Nunukan Island | 1 |
| Pangsuma Airport PSU | Putussibau-Borneo Island | 1 |
| ピトゥ空港 OTI | ピトゥ空港 | 1 |
| Rembele Airport TXE | タケンゴン | 1 |
| Singkawang Airport SKJ | シンカワン | 1 |
| Sultan Bantilan Airport TLI | Toli Toli-Celebes Island | 1 |
| Tebelian Airport SQG | Sintang | 1 |
| Tuanku Tambusai Airport PPR | Pasir Pengarayan | 1 |
| Wonopito Airport LWE | レウォレバ | 1 |
| Bilorai Airport UGU | Bilogai | — |
| LNG Badak Airport BXT | ボンタン | — |
| Nanga Pinoh Airport NPO | Nanga Pinoh-Borneo Island | — |
| Pendopo Airport PDO | Talang Gudang-Sumatra Island | — |
| ピナン・カンパイ空港 DUM | ドゥマイ | — |
| サンギア・ニバンデラ空港 KXB | サンギア・ニバンデラ空港 | — |
| Selayar - Haji Aroeppala Airport KSR | Benteng | — |
| Syekh Hamzah Fansyuri Airport FSH | Singkil | — |
| Tumbang Samba Airport TBM | Tumbang Samba-Borneo Island | — |
| Tunggul Wulung Airport CXP | Cilacap | — |
| Warukin Airport TJG | Tanta-Tabalong | — |